Boudewijn Zenden maakte zijn debuut in het betaalde voetbal in het shirt van PSV. Hier speelde hij vier seizoenen en vertrok daarna naar FC Barcelona. Hier speelde hij in totaal drie seizoenen en verkaste vervolgens naar Chelsea. In deze periode werd hij nog twee seizoenen verhuurd aan Middlesbrough.

In 2005 maakte Zenden de transfer naar Liverpool, hier behaalde hij de finale van de UEFA CHampions League in 2007, maar ze verloren van AC Milaan. De dag na de finale maakte trainer Rafael Benítez bekend dat Zenden transfervrij mocht vertrekken. Hierop tekende hij voor twee seizoenen bij Olympique Marseille, hier is hij nog steeds actief.

In het shirt van Oranje maakte hij de halve finales van het WK 98 en EK2000 en EK 2004 mee.